浴 俊彦(えき としひこ)
研究テーマ(シーズ2)
DNAメタバーコード法による土壌生物相分析
研究の技術分野 | 分子生物学、ゲノム科学、農業生物学 |
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研究の段階・状況 | 基礎開発研究の段階 |
キーワード | 土壌診断、土壌生物多様性、農業 |
提案者 | 浴 俊彦 応用化学・生命工学系 |
連絡先 | Tel :0532-44-6907 Fax :0532-44-6929 E-mail:eki@chem.tut.ac.jp |
土壌生物相を次世代シークエンサーによるDNAメタバーコード解析によって、高精度に遺伝子レベルで定量分析する。本法によって、農業土壌などの生物相(微生物、真核生物)を網羅的に明らかにでき、土壌診断や線虫害予測などへの応用が考えられる。
基本となる特許・解説記事・研究論文等
◆Hisashi Morise, Erika Miyazaki, Shoko Yoshimitsu, and Toshihiko Eki: Profiling nematode communities in unmanaged flowerbed and agricultural field soils in Japan by DNA barcode sequencing. PLoS One, 7(12), e51785 (10 pages) (2012)
◆Harutaro Kenmotsu, Kiichi Uchida, Yuu Hirose, and Toshihiko Eki: Taxonomic profiling of individual nematodes isolated from copse soils using deep amplicon sequencing of four distinct regions of the 18S ribosomal RNA gene. PLoS ONE, 15(10), e0240336 (31 pages) (2020)
◆Harutaro Kenmotsu, Masahiro Ishikawa, Tomokazu Nitta, Yuu Hirose, and Toshihiko Eki: Distinct community structures of soil nematodes from three ecologically different sites revealed by high-throughput amplicon sequencing of four 18S ribosomal RNA gene regions. PLoS ONE, 16(4), e0249571 (31 pages)(2021)
◆Harutaro Kenmotsu, Emi Takabayashi, Akinori Takase, Yuu Hirose, and Toshihiko Eki: Use of universal primers for the 18S ribosomal RNA gene and whole soil DNAs to reveal the taxonomic structures of soil nematodes by high-throughput amplicon sequencing. PLoS ONE, 16(11), e0259842 (31 pages)(2021)