中鉢 淳(なかばち あつし)
所属 | 先端農業・バイオリサーチセンター |
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兼務 | 応用化学・生命工学系 |
職名 | 准教授 |
専門分野 | 共生生物学、昆虫学、微生物学 |
学位 | 博士(理学) (東京大学) |
所属学会 | 日本ゲノム微生物学会、日本微生物生態学会、日本応用動物昆虫学会、日本動物学会、日本進化学会 |
nakabachi@eiiris ※アドレスの末尾に「.tut.ac.jp」を補完してください |
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研究室web | http://www.eiiris.tut.ac.jp/nakabachi.html |
研究者情報(researchmap) | 研究者情報 |
研究紹介
地球は生命に満ちあふれており、あらゆる生物は、環境中の他の生物と、何らかの相互作用を持って生活しています。我々人類も、もちろん例外ではありません。無数の微生物との関わり方が、ヒトの健康状態を規定する大きな要因となりますし、農業をはじめとする生物生産は、複雑な生物相において、人類に有用な生物群のみを、効率良く選抜育成する過程に他なりません。私たちの研究室では、こうした生物間相互作用、広義の共生現象に注目し、その成り立ちを理解することで、医療、衛生、食料生産などへの応用展開の基盤づくりをすすめています。
テーマ1:昆虫菌細胞内共生系の存立基盤の解明と新規害虫防除法の開発
概要
昆虫には「菌細胞(bacteriocyte, mycetocyte)」とよばれる特殊な細胞を持ち、この中に、相利共生細菌を保有しているものがいます。こうした細菌は、虫の親から子へと数千万年以上にわたって受継がれ、その過程で多くの遺伝子を失い、宿主と一体化するなど、ミトコンドリアや葉緑体といったオルガネラ(細胞小器官)と同様の特徴を持つため、複数生物間の融合機構の解明に絶好のモデルといえます。また、この共生系は、アブラムシやツェツェバエなどの重要な農業・衛生害虫の生存に必須である一方、我々ヒトを含む周辺環境中の他の生物には存在しないため、選択性が高く、安全で効果的な新規防除法開発の標的としても有望です。本研究室では、多様な手法を駆使して菌細胞内共生系の存立基盤を解明し、新たな防除法の開発につなげることを目標の一つとしています。
主な業績
Yasuda Y, Inoue H, Hirose Y, Nakabachi A. (2024) Highly reduced complementary genomes of dual bacterial symbionts in the mulberry psyllid Anomoneura mori. Microbes Environ 39(3):ME24041.
Nakabachi A, Suzaki T. (2024) Ultrastructure of the bacteriome and bacterial symbionts in the Asian citrus psyllid, Diaphorina citri. Microbiol Spectr 12(1):e0224923.
Nakabachi A, Moran NA. (2022) Extreme polyploidy of Carsonella, an organelle-like bacterium with a drastically reduced genome. Microbiol Spectr 10(3): e0035022.
Nakabachi A, Ishida K, Hongoh Y, Ohkuma M, Miyagishima SY. (2014) Aphid gene of bacterial origin encodes a protein transported to an obligate endosymbiont. Curr Biol 24(14): R640-R641.
Nakabachi A, Yamashita A, Toh H, Ishikawa H, Dunbar HE, Moran NA, Hattori M. (2006) The 160-kilobase genome of the bacterial endosymbiont Carsonella. Science 314 (5797): 267.
Nakabachi A, Shigenobu S, Sakazume N, Shiraki T, Hayashizaki Y, Carninci P, Ishikawa H, Kudo T, Fukatsu T. (2005) Transcriptome analysis of the aphid bacteriocyte, the symbiotic host cell that harbors an endocellular mutualistic bacterium, Buchnera. Proc Natl Acad Sci USA 102(15): 5477-82.
キーワード
テーマ2:共生系遺伝子資源からの新規有用物質の取得
概要
上記共生細菌類は、昆虫の細胞内という特殊な環境を利用しながら、宿主昆虫に何らかのメリットを与えるユニークな存在であり、人類にとって有用な物質を得るための遺伝子資源としても注目されます。実際に、私たちの先行研究などにより、昆虫共生細菌の中には強力な生理活性物質を生産するものがあることが分かって来ました。私たちは、様々な共生系について解析を進めて有用物質を探索しています。
主な業績
Takasu R, Izu T, Nakabachi A. (2024) A limited concentration range of diaphorin, a polyketide produced by a bacterial symbiont of the Asian citrus psyllid, promotes the in vitro gene expression with bacterial ribosomes. Microbiol Spectr 12(7):e0017024.
Takasu R, Yasuda Y, Izu T, Nakabachi A. (2024) Diaphorin, a polyketide produced by a bacterial endosymbiont of the Asian citrus psyllid, adversely affects the in vitro gene expression with ribosomes from Escherichia coli and Bacillus subtilis. PLoS One 8(11):e0294360.
Tanabe N, Takasu R, Hirose Y, Kamei Y, Kondo M, Nakabachi A. (2022) Diaphorin, a polyketide produced by a bacterial symbiont of the Asian citrus psyllid, inhibits the growth and cell division of Bacillus subtilis but promotes the growth and metabolic activity of Escherichia coli. Microbiol Spectr 10(4):e0175722.
Nakabachi A, Piel J, Malenovský I, Hirose Y. (2020) Comparative genomics underlines multiple roles of Profftella, an obligate symbiont of psyllids: providing toxins, vitamins, and carotenoids. Genome Biol Evol 12(11):1975-1987.
Nakabachi A, Okamura K. (2019) Diaphorin, a polyketide produced by a bacterial symbiont of the Asian citrus psyllid, kills various human cancer cells. PLoS One 14(6):e0218190.
Nakabachi A, Ueoka R, Oshima K, Teta R, Mangoni A, Gurgui M, Oldham NJ, van Echten-Deckert G, Okamura K, Yamamoto K, Inoue H, Ohkuma M, Hongoh Y, Miyagishima SY, Hattori M, Piel J, Fukatsu T. (2013) Defensive bacteriome symbiont with a drastically reduced genome. Curr Biol 23(15): 1478-84.
キーワード
テーマ3:農作物生産に関連する生物間相互作用の研究
概要
急激な人口増加に直面する人類の喫緊の課題のひとつに、食糧の増産があります。この実現に向け、本研究室では、非生物的環境-微生物-植物-動物(昆虫を含む)間の多様な相互作用の解明にも取り組み始めています。
主な業績
Nishino K, Inoue H, Hirose Y, Nakabachi A. (2024) Microbiome of psyllids of the family Aphalaridae, including Aphalara itadori, a biocontrol agent against Reynoutria spp. Entomol Exp Appl 172(11):1033-1045.
Maruyama J, Inoue H, Hirose Y, Nakabachi A. (2023) 16S rRNA gene sequencing of six psyllid species of the family Carsidaridae identified various bacteria including Symbiopectobacterium. Microbes Environ 38(3):ME23045.
Nakabachi A, Inoue H, Hirose Y. (2022) Microbiome analyses of 12 psyllid species of the family Psyllidae identified various bacteria including Fukatsuia and Serratia symbiotica, known as secondary symbionts of aphids. BMC Microbiol 22(1):15
Nakabachi A, Malenovský I, Gjonov I, Hirose Y. (2020) 16S rRNA sequencing detected Profftella, Liberibacter, Wolbachia, and Diplorickettsia from relatives of the Asian citrus psyllid. Microb Ecol 80(2):410-422.
Yamada T, Hamada M, Floreancig P, Nakabachi A. (2019) Diaphorin, a polyketide synthesized by an intracellular symbiont of the Asian citrus psyllid, is potentially harmful for biological control agents. PLoS One 14(5):e0216319.
Dan H, Ikeda N, Fujikami M, Nakabachi A. (2017) Behavior of bacteriome symbionts during transovarial transmission and development of the Asian citrus psyllid. PLoS One 12(12): e0189779.
Nakabachi A, Nikoh N, Oshima K, Inoue H, Ohkuma M, Hongoh Y, Miyagishima SY, Hattori M, Fukatsu T. (2013) Horizontal gene acquisition of Liberibacter plant pathogens from a bacteriome-confined endosymbiont of their psyllid vector. PLoS One 8(12): e82612.
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担当授業科目名(科目コード)
環境生物工学 (B14620350)
生命工学特論Ⅰ (D34030040)
食農技術科学特論Ⅱ (M24630450)
生命・物質特別講義 (S14620430)
その他(受賞、学会役員等)
2019年4月 長瀬研究振興賞
2010年3月 第3回日本ゲノム微生物学会研究奨励賞受賞